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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Meio Ambiente. |
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Data corrente: |
01/08/2013 |
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Data da última atualização: |
02/08/2013 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SAWAZAKI, H. E.; SA, L. A. N. de; GONÇALVES, C. R. N. C. B.; VEIGA, R. F. A.; COLOMBO, C. A. |
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Afiliação: |
HAIKO ENOK SAWAZAKI, IAC; LUIZ ALEXANDRE NOGUEIRA DE SA, CNPMA; CASSIARA REGINA NOVENTA CORREA BARBOSA GONÇALVES, CTC; RENATO FERRAS DE ARRUDA VEIGA, IAC; CARLOS AUGUSTO COLOMBO, IAC. |
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Título: |
Molecular diagnosis optimization of virus, bacteria and fungi in sugarcane. |
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Ano de publicação: |
2013 |
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Fonte/Imprenta: |
Internacional Research Journal of Plant Science, Sapele, v. 4, n. 3, p. 76-83, 2013. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract: Aiming at optimizing the diagnosis of major sugarcane diseases by PCR, primers were developed (scald, orange rust) and amplified fragments according to the literature were used as positive control, such as those caused by: 1 - Bacteria, (ratoon stunting and leaf scald) 2 - Viruses, (yellow leaf, mosaic, mosaic streak and fijivirus) 3-Fungus, (smut, orange rust and curvularia). For diseases with long latency period (leaf scald, ratoon stunting, yellow leaf, mosaic, fijivirus, smut and orange rust), primers were designed for real time PCR. For testing, infected leaves, fungal colonies, amplified DNA fragment or 40 seedlings were used. Real time PCR analyses have enabled the detection of sugarcane samples with highest dilution of DNA. The pair of primers designed for orange rust was more specific. The pair of primers designed for scald, apparently was not able to distinguish only bacteria of the genus Erwinia, whereas the primers described in the literature were observed amplify others genera, such as Xanthomonas, Pseudomonas, Erwinia, Stenotrophomona and Pantoea. The three strains of the fungus curvularia, found in sugarcane, resembled more to the species C.cymbopogonis, C.geniculata, C.sp. Of the 28 primer pairs tested, the best were shown for each of the disease-causing agent. |
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Palavras-Chave: |
Leaf scald; PCR. |
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Thesagro: |
Bactéria; Cana de açúcar; Diagnóstico; Doença de planta; Escaldadura; Ferrugem alaranjada; Fungo; Vírus. |
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Thesaurus Nal: |
Curvularia; Fijivirus; Plant diseases and disorders; Polymerase chain reaction; Ratoon stunting disease; Rust diseases; Scald diseases; Smut diseases; Sugarcane; Sugarcane streak virus; Sugarcane yellow leaf virus. |
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Categoria do assunto: |
H Saúde e Patologia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/86855/1/2013AP16.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Meio Ambiente (CNPMA) |
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| Registros recuperados : 125 | |
| 1. |  | TELES, E.; XAVIER, J. F.; ARCENIO, F. S.; AMAYA, R. L.; GONÇALVES, J. V. S.; ROUWS, L. F. M.; ZONTA, E.; COELHO, I. S. Characterization and evaluation of potential halotolerant phosphate solubilizing bacteria from Salicornia fruticosa rhizosphere. Frontiers in Plant Science, v. 14, article 1324056, 2024.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 2. | | SCHWAB, S.; HIRATA, E. S.; AMARAL, J. C. A.; SILVA, C. G. N.; FERREIRA, J. P.; SILVA, L. V. da; ROUWS, J. R. C.; ROUWS, L. F. M.; BALDANI, J. I.; REIS, V. M. Quantifying and visualizing Nitrospirillum amazonense strain CBAmC in sugarcane after using different inoculation methods, Plant and Soil , Published: 22 February 2023.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 3. | | SILVA, T. R. da; RODRIGUES, R. T.; JOVINO, R. S.; CARVALHO, J. R. de S.; LEITE, J.; HOFMANN, A.; FISCHER, D.; RIBEIRO, P. R. de A.; ROUWS, L. F. M.; FERNANDES JUNIOR, P. I.; RADL, V. Not just passengers, but co-pilots! Non-rhizobial nodule-associated bacteria promote cowpea growth and symbiosis with (brady)rhizobia. Journal of Applied Microbiology, v. 134, n, 123, January 2023.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia; Embrapa Semiárido. |
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| 4. | | SILVA, C. G. N. da; LAMMEL, D.; MOREIRA, F. S.; SILVA. L. C.; GROSS, E.; ZILLI, J. E.; ROUWS, L. F. M.; REIS, V. M.; REIS JUNIOR, F. B. dos; SIMON, M. F.; JAMES, E. K.; CRUZ, L. M. Diversity of symbiotic beta-rhizobia nodulating mimosa species in different brazilian biomes. In: INTERNATIONAL LEGUME CONFERENCE, 8., 2023, Pirenópolis. Integrating knowledge on the legume family: [abstracts]. Pirenópolis: [s.n.], 2023.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 5. | | SILVA, R. S. da; LAMMEL, D. R.; MOREIRA, F. S.; SILVA, L. C.; GROSS, E.; ZILLI, J. E.; ROUWS, L. F. M.; REIS, V. M.; REIS JUNIOR, F. B. dos; SIMON, M. F.; JAMES, E. K.; CRUZ, L. M. Diversity of symbiotic beta-rhizobia nodulating Mimosa species in different Brazilian biomes. In: INTERNATIONAL LEGUME CONFERENCE, 8., 2023, Pirenópolis. Integrating knowledge on the legume family: [abstracts]. Pirenópolis: [s.n.], 2023.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 6. | | GIORDANO, D. F.; PASTOR, N.; ROUWS, L. F. M.; FREITAS, K. M. de; DEL CANTO, I.; ERAZO, J.; COELHO, I. S.; ODDINO, C. M.; TORRES, A. Trichoderma harzianum ITEM 3636 colonizes peanut roots as an endophyte and protects the plants against late leaf spot Symbiosis, v. 89, p. 337-352, 2023.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 7. | | GIORDANO, D. F.; ROUWS, L. F. M.; FREITAS, K. M. de; ERAZO, J.; PASTOR, N.; DEL CANTO, I.; COELHO, I. S.; ODDINO, C. M.; TORRES, A. Evaluation of Trichoderma harzianum ITEM 3636 as a potential endophyte and biocontrol agent against late leaf spot in peanut Phytopathology, v. 112, n. 3, p. 6, Suplemento S, mar. 2022.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 8. | | SILVA, J. P. D.; SILVA, A. de C.; ROUWS, L. F. M.; FREITAS, K. M. de; RICALDE, M. P.; SILVA, A. P. L. Determinação de parâmetros para sexagem de Sternochetus mangiferae (Coleoptera: Curculionidae) utilizando microscopia eletrônica de varredura. In: SEMANA CIENTÍFICA JOHANNA DÖBEREINER, 22., 2022, Seropédica. Bicentenário da Independência: 200 anos de ciência, tecnologia e inovação no Brasil: caderno de resumos... Seropédica: Embrapa Agrobiologia, 2022.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 12. | | NOVAIS, C. B. de; SBRANA, C.; JESUS, E. da C.; ROUWS, L. F. M.; GIOVANNETTI, M.; AVIO, L.; SIQUEIRA, J. O.; SILVA, E. M. R. da; FARIA, S. M. de. Mycorrhizal networks facilitate the colonization of legume roots by a symbiotic nitrogen-fixing bacterium. Mycorrhiza, published Online: 25 march 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 15. | | ZILLI, J. E.; ALVES, B. J. R.; ROUWS, L. F. M.; ARAUJO, J. L. S. de; SOARES, L. H. de B.; CASSAN. F; O HARA, G. The importance of denitrification performed by nitrogen-fixing bacteria used as inoculants South America. Plant and Soil,, v; 451, p. 5-24, 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 16. | | FERREIRA, N. S.; MATOS, G. F.; MENESES, C. H. G. de; REIS, V. M.; ROUWS, J. R. C.; SCHWAB, S.; BALDANI, J. I.; ROUWS, L. F. M. Interaction of phytohormone-producing rhizobia with sugarcane mini-setts and their effect on plant development Plant and Soil, Published online 3 January, 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 17. | | ZILLI, J. E.; ARAUJO, J. L. S. de; ROUWS, L. F. M.; SOARES, L. H. de B. Draft genome sequence of Bradyrhizobium elkanii BR 2003, an eficient rhizobium strain for Cajanus, Canavalia, Crotalaria, and Indigofera. Microbiology Resource Announcements, v. 9, n. 11, e01565-19, 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
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| 19. | | SOUZA, M. L. da C.; SCHWAB, S.; BALDANI, J. I.; ROUWS, L. F. M. Marcação de Bradyrhizobium spp. com proteína verde fluorescente. In: SEMANA CIENTÍFICA JOHANNA DÖBEREINER, 19, 2019, Seropédica, RJ. Bioeconomia, diversidade e riqueza para o desenvolvimento sustentável. Caderno de resumos... Seropédica: Embrapa Agrobiologia, 2019.| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 20. | | SILVA, E. M. N. da; FERNANDES, M. F. R.; ZILLI, J. E.; ROUWS, L. F. M. Efeito antifúngico de bactérias de solo de rizosfera de cana-de-açúcar. In: SEMANA CIENTÍFICA JOHANNA DÖBEREINER, 19, 2019, Seropédica, RJ. Bioeconomia, diversidade e riqueza para o desenvolvimento sustentável. Caderno de resumos... Seropédica: Embrapa Agrobiologia, 2019.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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